Prof. Dr. Mustafa Şahin, arkeoloji alanında uzmanlaşmış deneyimli bir akademisyendir. 1981-1985 yılları arasında Atatürk Üniversitesi Fen-Edebiyat Fakültesi, Arkeoloji Bölümü'nde lisans eğitimini tamamlamış, ardından aynı üniversitede yüksek lisans ve doktora eğitimlerini sürdürmüştür. Yüksek lisans tezi "Hermogenes Sorunu", Doktora tezi "Miletupolis Kökenli Figürlü Mezar Stelleri ve Adak Levhaları" üzerinedir.

Kariyerine 1990 yılında Selçuk Üniversitesi Fen-Edebiyat Fakültesi, Arkeoloji Bölümü'nde Araştırma Görevlisi olarak başlamış olan Prof. Dr. Şahin, akademik kariyerinde hızla ilerlemiştir. 1997 yılında Doçent, 2003 yılında Profesör unvanlarını kazanmıştır. 2003-2005 yılları arasında Selçuk Üniversitesi'nde profesörlük yapmış, 2005 yılında ise Bursa Uludağ Üniversitesi Fen-Edebiyat Fakültesi, Arkeoloji Bölümü'ne geçmiştir ve burada görevine devam etmektedir.

Prof. Dr. Şahin'in uzmanlık alanları arasında arkeoloji ve klasik arkeoloji bulunmaktadır. Kendisi, pek çok farklı dersin yanı sıra "Antik Çağda Bursa ve Çevresi", "Antik Çağ Mezar Plastiği", "Arkeolojik Araştırmalarda Güncel Yaklaşımlar" ve "İ.Ö. 2. Yüzyıl Heykel Sanatı" derslerini vermiştir.

Uludağ Üniversitesi'nde çeşitli akademik ve idari görevler üstlenmiştir. Bu görevler arasında Bölüm Başkanlığı, Uygulama ve Araştırma Merkezi Müdürlükleri, Bölüm Kalite Komisyonu Başkanlığı, Bölüm Akademik Teşvik Değerlendirme Komisyonu Başkanlığı ve Anabilim/Bilim Dalı Başkanlığı bulunmaktadır.

Öğrencileri tarafından kaleme alınmış birçok tezde danışmanlık yapmış olan Prof. Dr. Şahin, bu süreçte arkeoloji ve antik dönem hakkında geniş bir yelpazede konuları ele almıştır. Bu konular arasında "Mysia Olympos'undaki Kültler", "Arkeolojik ve Epigrafik Bulgular Işığında Nikaia'da Romalılaşma", "Mozaikler Işığında Villa Rustika" ve "Nikaia Kıyı Şeridi Sualtı Kalıntıları" gibi çalışmalar bulunmaktadır.

Prof. Dr. Şahin, birçok tez projesine danışmanlık yapmanın yanı sıra, Almanca ve İngilizce bilmektedir.